Poput ribe, mesa, jaja, mlijeka i druge životinjske hrane, soja sadrži bolji uzorak proteina i aminokiselina, koji je više u skladu sa potrebama ljudskog tijela i ima veću hranjivu vrijednost.
Iakoprotein sojeje bolji protein, ali ima i boljih od.Protein sojeima manje esencijalnih aminokiselina zvanih methionin, ne samo manje od životinjskih proteina, već i manje od nekih proteina žitarica. Ako se soja koristi kao hrane za stoku, potrebno je dodati nešto metiona kako bi se zaišle potrebe stoke. Osim toga, lizin usoja proteinnije stabilna, koja se gubi u preradi proizvoda od soje, što rezultira nedovoljnim sadržajem. Stogaprotein sojeima manje nuttricione vrijednosti od kravljeg mliječnog proteina (proteina sirute), bjelančevina jaja, ili mesnog proteina.
Zapravo, prednost soje nije u tomeprotein sojeje bolji od životinjskih proteina, međutim soja i njegovi proizvodi ne sadrže holesterol, sadržaj masnih organa je nizak, i uglavnom biti nezasićena masna kiselina, to je rijetko i vrijedno za kardiovaskularne bolesti kao što su pretilost prevenciji i lijeku i hipertenziji, abnormalna masnoća u krvi, koronarna bolest srca. U tu je 1999. godinu FDA dozvolila proizvođačima soje da tvrde da "protein sojemože smanjiti rizik od srčanih bolesti" i da "jede 25 gramaprotein sojednevno kao dio prehrane nizak zasićenih masnoća i holesterola može smanjiti rizik od srčanih bolesti."
Osim toga, soja je jedna od biljnih hrana sa visokim sadržajem proteina i dobrim kvalitetom, a bogata je lizinom, što može poboljšati ukupnu prehransku vrijednost kroz komplementarne efekte kada se jede zajedno sa žitaricama.
